El entorno natural
La ecología del Santuario es sumamente diversa y compleja, ya que incluye diez zonas de vida, desde el bosque seco montano bajo -a orillas del valle- hasta el nivel en las cumbres de la cordillera. En términos altitudinales, esto significa que se extiende desde los 1,725 m.s.n.m. a nivel del río Urubamba, hasta los 6,271 m.s.n.m. en la cumbre del nevado Salcantay. Estas variaciones geográficas, y su singular topografía, tienen por consecuencia una diversidad muy amplia de flora y fauna silvestres.

El paraíso de los botánicos
Las variadas condiciones medioambientales han permitido la generación de una flora muy diversa, cubriéndose una enorme gama que va desde cerrados bosques propios de ceja de selva hasta ralas cumbres de montaña. Por todo ello, Machu Picchu ha sido calificado, no sin razón, como el paraíso de los botánicos.

La vegetación forestal está representada por especies madereras como el cedro, romerillo o intimpa, laurel, etc. Además, de las especies mencionadas predominan los géneros Ocotea, Pedocarpus, Guarea, Weinmania, Clusia, Cedropia, Cinchena, Eritrina o Pisonay, Ilex entre otros. De igual manera, existen muchas especies de begonias y puyas. Pero obviamente, dentro de la flora característica, la que más llama la atención son las orquídeas; se han identificado más de 30 géneros y alrededor de 100 especies, muchas de las cuales se encuentran en vías de extinción.

Refugio animal
La fauna de Machu Picchu es tan abundante como variada. Destacan varias especies en vías de extinción, como el oso de anteojos, el gallito de las rocas y el venado enano, por lo que el gobierno del Perú ha declarado la zona como una Área Natural Protegida. Existen, asimismo, muchas otras especies, como el puma, el zorro andino, la nutria de río, la taruca, el gato montes, el hurón; numerosas aves entre las que destaca el cara-cara, los picaflores, el pato de los torrentes, los loros, la pava de monte y muchas aves menores de variado colorido; reptiles como el jergón bothrops y el coral micrurus, peligroso por su activo veneno; lagartos, ranas, quirópteros y una numerosa entomofauna andina y amazónica que se compenetra en la zona, las que hacen del Santuario un lugar donde la observación y el estudio se conviertan en un atractivo adicional para turistas o investigadores.

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